Je pense que (sans aucune certitude) :
Si l'entrée de la boite est plus petite ca va réduire le débit d'air et de même si la surface filtrante est réduite.
Dans tous les cas si la boite ne répond pas au besoin moteur, ca entrainera certainement une perte de couple et puissance sur les injections et les carbu en plus, verront leur richesse augmenter.
Par contre je sais pas du tout si les boites d'origine sont juste capacitaires ou si elles sont prévues plus grande par sécurité ou pour amoindrir les pertes liées à l'encrassement du filtre.